疫情牽動(dòng)著人們的心，病毒基因組測(cè)序分析工作尤為迫切。為支持北京市疫情防控技術(shù)需要，中國(guó)疾控中心病毒病所應(yīng)急技術(shù)中心在6月11日接收到北京市疾控中心送檢4份病例標(biāo)本后，馬上開展核酸檢測(cè)與基因組測(cè)序等應(yīng)急支撐工作，6月12日第一時(shí)間完成相關(guān)病例樣本病毒全基因組序列測(cè)定和分析工作，并及時(shí)報(bào)告給國(guó)家衛(wèi)健委及北京市相關(guān)部門，為北京新冠肺炎疫情防控與病毒溯源提供重要科技支撐。
這次中國(guó)疾控中心迅速完成病毒全基因組序列測(cè)定和分析工作，“中國(guó)CDC應(yīng)急技術(shù)中心-百度基因測(cè)序工作站”發(fā)揮了重要作用。中國(guó)疾控中心病毒病所應(yīng)急技術(shù)中心主任譚文杰表示，基于團(tuán)隊(duì)前期建立優(yōu)化的新冠全基因組測(cè)序技術(shù)方案，借助百度資助的先進(jìn)測(cè)序儀，樣本接收后10個(gè)小時(shí)即完成了北京四個(gè)樣本的全基因組測(cè)序。這也是百度的AI大數(shù)據(jù)能力支持的“中國(guó)CDC應(yīng)急技術(shù)中心-百度基因測(cè)序工作站”首戰(zhàn)告捷。
為共同推動(dòng)新冠肺炎病毒基因組分析與新型疫苗研究工作，今年4月，百度與中國(guó)疾病預(yù)防控制中心病毒病預(yù)防控制所簽署戰(zhàn)略合作協(xié)議，雙方聯(lián)合設(shè)立“中國(guó)CDC應(yīng)急技術(shù)中心-百度基因測(cè)序工作站”。同時(shí)，百度為該工作站配備了一整套先進(jìn)的二代與三代測(cè)序設(shè)備平臺(tái)，并協(xié)商制定了全面開展新冠肺炎相關(guān)研究的合作計(jì)劃，基于百度研發(fā)的線性二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)算法LinearFold、mRNA疫苗二級(jí)結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)算法LinearDesign、Covseq新型冠狀病毒分析溯源可視化平臺(tái)等領(lǐng)先技術(shù)，助力新冠肺炎相關(guān)研究，并長(zhǎng)期支持公共衛(wèi)生相關(guān)科學(xué)研究。
疫情爆發(fā)以來，百度持續(xù)運(yùn)用AI、大數(shù)據(jù)等前沿技術(shù)助力疫情防控。
目前，百度研究院研發(fā)的線性二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)算法LinearFold已經(jīng)陸續(xù)在各基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)、防疫中心及全世界科學(xué)研究中心投入應(yīng)用。LinearFold可將此次新型冠狀病毒的全基因組二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)從55分鐘縮短至27秒，提速120倍，節(jié)省了兩個(gè)數(shù)量級(jí)的等待時(shí)間，是RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)領(lǐng)域40年來第一次重大提速。1月30日，百度已向全球免費(fèi)開放LinearFold算法及世界上現(xiàn)有最快的RNA結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)網(wǎng)站，以提升新型冠狀病毒RNA空間結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)速度。
基于LinearFold算法，百度研究院5月推出全球首個(gè)mRNA疫苗基因序列設(shè)計(jì)算法LinearDesign，專門用于優(yōu)化mRNA序列設(shè)計(jì)的高效算法。LinearDesign能在16分鐘內(nèi)大大提升mRNA疫苗設(shè)計(jì)的穩(wěn)定性和蛋白質(zhì)表達(dá)水平，大大加速疫苗研發(fā)速度。中國(guó)疾病預(yù)防控制中心后續(xù)將使用LinearDesign算法設(shè)計(jì)的mRNA疫苗序列進(jìn)行體外實(shí)驗(yàn)，驗(yàn)證疫苗的穩(wěn)定性和蛋白質(zhì)表達(dá)效率。
當(dāng)下新型冠狀病毒還在持續(xù)變異中，對(duì)病毒進(jìn)行監(jiān)控、溯源和研究追蹤對(duì)于了解疫情源頭，控制疫情傳播至關(guān)重要。百度也將持續(xù)和中國(guó)疾控中心病毒病所合作，以“中國(guó)CDC應(yīng)急技術(shù)中心-百度基因測(cè)序工作站”為基地，提供包括病毒進(jìn)化樹分析，病毒變異追蹤、溯源、可視化等一體化算法能力，幫助后者實(shí)現(xiàn)快速病毒測(cè)序，分析和監(jiān)控，共同推動(dòng)新冠肺炎相關(guān)研究，早日戰(zhàn)勝疫情。
